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4点，他作另一次散步，然后工作一个多小时。接下来，在听一段时间的小说后，他用晚餐，与妻子玩两轮十五子游戏，读一本科学书籍的部分内容，最后，感到疲倦时，他又坐到沙发上听他妻子念小说或弹钢琴。当他在10点或10点半就寝时，他经常躺在床上睡不着，在痛苦中煎熬好几个小时。在糟糕的日子，他会完全放弃工作。（关于选择的过程，他这样写道：“……在相同物种的个体之间，这种竞争几乎总是非常残酷的，因为它们出现在相同的地方，寻求相同的食物，面临相同的危险。”）
在一封写给莱尔的信中，他说他为得出了这样的结论“竞争是为强者而存在的”感到非常沮丧，但他所能做的不外就是去赞美其他人在科学中所能取得的那些进步。（他写道，“……那些最敏捷、最狡猾的狼拥有最大的生存机会，所以，它们也最容易被选择，并保存下来。”）由于他自己糟糕的身体状况，他祖父、他兄弟、他姨妈、姨婶的身体状况（他写道：“……我们的无知是如此深沉，我们的傲慢是如此严重，难怪我们听到某一物种灭绝时会感到吃惊，因为我们不知道灭绝的原因，所以，我们才酿成了灾难……”），由于他妻子遭受的严重的头痛病（他写道，“只有通过细微的遗传变异、对保护物种有利的每个特征的保存与积累，自然选择才会发挥作用……”），他为他孩子的健康担心，因为他们之中有一个出生不久之后就死了，有一个童年就夭折了，而其余的孩子则在承受慢性疾病的痛苦。
1844年，就进化论的发现，他这样写道：“当最后的光明来临之际，我已经坚信（与我开始的观点完全相反）物种（仿佛这是在听一个负罪之人的忏悔）并不是一成不变的。”
[约翰内斯?开普勒，1571-1630]
在关押了14个月后，玛?开普勒（凯瑟琳）被放了出来。尽管民众对处死她充满了恐惧，她也不能回到列恩堡。6个月后，她去世。
就是在这样的背景下，开普勒写出了他的《宇宙和谐论》……
阿瑟罗?卡斯特：《转折》
她被人用一个橡木箱子从她家里带走，并送到了列恩堡的那座监狱。当时她73岁。（他写到，上帝本人“太仁慈了，以致不能拥有余暇去玩签名游戏，把他的喜爱签写在世界之中。”）人们对她提出了49个罪名，另外还有无数多的指控。人们告诉她，当有人念《圣经》给她听时，她不得哭泣。（他解决了正多边形的对称问题。）凯瑟琳?开普勒回答道，在她的一生中她已经流过太多的眼泪，已没有什么多余的眼泪可流了。（他认为，由于它们挑战了人类的智力，那些正多边形和所有不能用圆规和尺子画出的图形，实际上都是含糊不清的。它们是一种不可描述、不可进入、不可言说、不可触摸的存在，是一种虚无。他写道，这就是“上帝为什么不采用七边形和其他类似的图形来美化世界的原因。”）她的儿子约翰内斯?开普勒通过一篇有争议的辩词来对这个有罪的判决作了回答，这篇辩词被一个赞同判决的陈述给否定了，针对这一陈述，有人提出了一份有保留和争议的辩解，并且通过一种抗辩与反驳来对它作出了说明。最后，在为她的辩护中，她儿子提出了一份长达128页的最后陈述。（当时，他发现那些存在在天体运动中的正多边形。对这些正多边形，他写道：“天体运动什么也不是，仅仅是用几种声音唱出的一首连续的歌……是一种在无穷的时间之河中安置里程碑的音乐。”）
之后，按照那位公爵的要求，她的案子被送到了她儿子的大学，那儿的全体人员作出裁决，认为凯瑟琳应该在用刑的情况下接受审问，只是建议审讯过程应该控制在这样的范围，即在用刑的威胁下进行审问。（作为《宇宙和谐论》的一个内容，开普勒发现行星公转周期的平方等于轨道半长轴的立方。）她被带到受刑拷问的地方，行刑者出现她面前。他把所有的刑具向她作了展示，并且描述了它们对身体可能会造成的影响。人们告诉她，如果她不悔罪，那等待着她的就是巨大的痛苦与悲伤。那地方的恐惧已经让她之前的许多人作出了忏悔，但她说即使割破她身上的一根根血管，她也不会去忏悔。（由于他发现天体是按椭圆而不是完美的圆形轨道来运行的，他争辩说，为了消除大量的废物，人们就必须把一辆装废物的小车带到这个世界上来。）她跪在地上，祈求上帝给出一个证明，证明她是否是一个女巫或怪物，然后，她说她愿意去死，这样一来，在她死后，上帝就会澄明事物的真相。（他写道：“是的，我本人已不再相信那些神圣的疯话。我嘲讽地蔑视所有作这种公开忏悔的人；我窃取埃及人的那个金杯是想为我的上帝造出一只圣盘……”）就这样，由于他儿子的努力，他博得了世人的敬重，凯瑟琳·开普勒被无罪释放。
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